引物设计工具Primer Premier 5破解教程(附注册机)
来源: 互联网 编辑:星星软件园 时间:11-07

Primer Premier 5是为医药行业的用户打造的一款实用引物设计软件,软件可以方便专业的人员进行PCR、测序引物、杂交探针的设计操作,集合了酶切分析窗口、纹基分析窗口、引物设计窗口、序列编辑窗口等,可以方便用户快速得出引物分析的结果,软件还可以针对模板dna的来源以相应的遗传密码规则转换dna 和氨基酸序列,有需要的用户快快下载吧。

安装教程

1、双击“Primer Premier 5.exe”进入到软件操作界面

Primer Premier 5 v5.00破解版

2、打开软件之后将会弹出以下界面,点击Active Product按钮,看到一个2位数的Machine ID

Primer Premier 5 v5.00破解版

3、把Machine ID输入Primer Keygen,点击Generate生成激活码

Primer Premier 5 v5.00破解版

4、把激活码输入Primer Premier,点击ok即可弹跳出成功的指示

Primer Premier 5 v5.00破解版

5、然后就可以使用软件的全部功能了

Primer Premier 5 v5.00破解版

软件特色

-给专业人员带来的极大的便利,另外小编为大家带来的这款最新版本功能更加强大,立足点也是按照引物设计的基本原则,只是更加快速和自动化而已

-是款用软件设计引物软件,该软件分为四大块,尤其常用的是引物设计、限制性内切酶位点分析和DNA 基元(motif)查找

-我们可以直接提交模板序列到特定网页,如著名的primer3,得到设计好的引物,也可以在本地计算机上运行引物设计专业软件

主要功能

1、软件的主要功能分四种,即引物设计、限制性内切酶位点分析、dna 基元(motif)查找和同源性分析功能。前三种为其主要功能。此外,该软件还有一些特殊功能,其中最重要的是设计简并引物,另外还有序列朗读、dna 与蛋白序列的互换、语音提示键盘输入等等。

2、还可以针对模板dna 的来源以相应的遗传密码规则转换dna 和氨基酸序列。软件共给出八种生物亚结构的不同遗传密码规则

供用户选择,有纤毛虫大核(ciliate macronuclear)、无脊椎动物线粒体(invertebrate mitochondrion)、支原体(mycoplasma)、植物线粒体(plant mitochondrion)、原生动物线粒体(protozoan mitochondrion)、一般标准

(standard)、脊椎动物线粒体(vertebrate mito-chondrion)和酵母线粒体(yeast mitochondrion)。

使用技巧

一、限制性酶切点分析及基元查找功能

1.其主要功能在主界面上一目了然。限制性酶切点分析及基元查找功能比较简单,点击该功能按钮后,选择相应的限制性内切酶或基元(如-10 序列,-35 序列等),按确定即可

2.常见的限制性内切酶和基元一般都可以找到,你还可以编辑或者添加新限制性内切酶或基元

二、引物设计

1.打开DNA序列后点击按钮primer,出现“search criteria”窗口,有多种参数可以调整

2.搜索目的(Seach For)有三种选项,PCR 引物(PCR Primers)、测序引物(Sequencing Primers)和杂交探针(Hybridization Probes)

3.搜索类型(Search Type)可选择分别或同时查找上、下游引物(Sense/Anti-sense Primer,或Both),或者成对查找(Pairs),或者分别以适合上、下游引物为主(Compatible with Sense/Anti-sense Primer)。另外还可改变选择区域(Search Ranges),引物长度(Primer Length),选择方式(Search Mode),参数选择(Search Parameters)等等

3.使用者可根据自己的需要设定各项参数。如果没有特殊要求,建议使用默认设置。然后按search,随之出现的Search Progress 窗口中显示Search Completed 时,再按OK,这时搜索结果以表格的形式出现,有三种显示方式,上游引物(Sense),下游引物(Anti-sense),成对显示(Pairs)。默认显示为成对方式,并按优劣次序(Rating)排列,满分为100,即各指标基本都能达标

三、引物点击

1.点击其中一对引物,如第1#引物,并把上述窗口挪开或退出,显示“Peimer Premier”主窗口,所得结果分三部分,

2.模板及产物位置,中间是所选的上下游引物的一些性质,最下面是四种重要指标的分析,包括发夹结构(Hairpin),二聚体(Dimer),错误引发情况(False Priming),及上下游引物之间二聚体形成情况(Cross Dimer)

3.当所分析的引物有这四种结构的形成可能时,按钮由变成,点击该按钮,在左下角的窗口中就会出现该结构的形成情况

4.一对理想的引物应当不存在任何一种上述结构,因此最好的情况是最下面的分析栏没有,只有。值得注意的是中间一栏的末尾给出该引物的最佳退火温度

四、引物修饰编辑

1.在需要对引物进行修饰编辑时,如在5’端加入酶切位点,可点击,然后修改引物序列

2.若要回到搜索结果中,则点击按钮。如果要设计简并引物,只需根据源氨基酸序列的物种来源选择前述的八种遗传密码规则,反推至DNA 序列即可3.对简并引物的分析不需像一般引物那样严格

4.总之,“Premier”有优秀的引物自动搜索功能,同时可进行部分指标的分析,而且容易使用,是一个相当不错的软件

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